根据美国电影学院AFI的电影资料，史坦顿在1992年参观加州瓦列霍的海洋世界时，开始萌生一个有关鱼爸爸寻找失踪儿子的故事构想。
此外，他小时候曾经在牙医诊所看见鱼缸，对鱼缸里的鱼产生好奇，也成为电影中尼莫被带到牙医诊所的创作灵感。
另一个重要的创作来源，则是他对自己身为父亲的观察与反思。
史坦顿曾思考父母为了保护孩子，是否有时会过度限制孩子的自由，以及孩子又应该如何在成长过程中学习。
这些生活经验逐渐结合成电影的核心故事：一位过度保护孩子的父亲，为了寻找失踪的儿子，展开一场跨越海洋的冒险旅程。
创作团队希望透过马林与尼莫的故事，让观众从父亲与孩子两种不同的角度，理解亲情、信任、勇气与成长的意义。
此外，制作团队也希望将澳洲大堡礁丰富的海洋生态搬上大银幕，让观众彷佛真正置身於海底世界。
二制作过程中遭遇的困难
1.水下环境与海洋光影的呈现非常困难
《海底总动员》最大的技术挑战之一，就是如何透过电脑动画呈现真实而生动的海底世界。
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